Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl29Q80T74 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl29Q80T74 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl29Q80T74 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl29Q80T74 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl29Q80T74 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl29Q80T74 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl29Q80T74 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Klhl29Q80T74 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl29Q80T74 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms