Protein–RNA interactions for Protein: Q80SY5

Prpf38b, Pre-mRNA-splicing factor 38B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38bQ80SY5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf38bQ80SY5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf38bQ80SY5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf38bQ80SY5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms