Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna12Q80SS5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ifna12Q80SS5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms