Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sgo2Q7TSY8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sgo2Q7TSY8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms