Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ48

Srl, Sarcalumenin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrlQ7TQ48 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SrlQ7TQ48 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrlQ7TQ48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrlQ7TQ48 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1231.2 ms