Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Letm2Q7TNU7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Letm2Q7TNU7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Letm2Q7TNU7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Letm2Q7TNU7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Letm2Q7TNU7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms