Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed3Q78IS1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms