Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssx9Q6XAS3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssx9Q6XAS3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssx9Q6XAS3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms