Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrn2Q6PHP6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrn2Q6PHP6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrn2Q6PHP6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms