Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mfsd13aQ6PDE8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mfsd13aQ6PDE8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd13aQ6PDE8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms