Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smchd1Q6P5D8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smchd1Q6P5D8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms