Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx19Q6P4T1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx19Q6P4T1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms