Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrig3Q6P1C6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrig3Q6P1C6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrig3Q6P1C6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms