Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2surpQ6NV83 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
U2surpQ6NV83 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms