Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Arhgap20Q6IFT4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms