Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc3c1Q6DFV6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Fndc3c1Q6DFV6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms