Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT1

Fan1, Fanconi-associated nuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fan1Q69ZT1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fan1Q69ZT1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fan1Q69ZT1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fan1Q69ZT1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fan1Q69ZT1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fan1Q69ZT1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fan1Q69ZT1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fan1Q69ZT1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Fan1Q69ZT1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fan1Q69ZT1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fan1Q69ZT1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Fan1Q69ZT1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Fan1Q69ZT1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Fan1Q69ZT1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fan1Q69ZT1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fan1Q69ZT1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fan1Q69ZT1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fan1Q69ZT1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fan1Q69ZT1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fan1Q69ZT1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms