Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BegainQ68EF6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BegainQ68EF6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BegainQ68EF6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BegainQ68EF6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BegainQ68EF6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BegainQ68EF6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms