Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4eQ66X19 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4eQ66X19 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4eQ66X19 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms