Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou4f3Q63955 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou4f3Q63955 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms