Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup62Q63850 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup62Q63850 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup62Q63850 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup62Q63850 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup62Q63850 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup62Q63850 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193 ms