Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa4Q62425 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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