Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfrcQ62351 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TfrcQ62351 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TfrcQ62351 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms