Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd180Q62192 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd180Q62192 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms