Protein–RNA interactions for Protein: Q62011

Pdpn, Podoplanin, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdpnQ62011 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdpnQ62011 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdpnQ62011 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdpnQ62011 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms