Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ltbp3Q61810 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltbp3Q61810 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltbp3Q61810 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms