Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itga6Q61739 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Itga6Q61739 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Itga6Q61739 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms