Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn2Q61330 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn2Q61330 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn2Q61330 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn2Q61330 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn2Q61330 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn2Q61330 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn2Q61330 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms