Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tfap2bQ61313 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfap2bQ61313 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms