Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf3Q60803 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms