Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb6Q60692 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms