Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl17Q5UW37 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl17Q5UW37 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms