Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsr1Q5SWD9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms