Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms