Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bbs12Q5SUD9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms