Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85aQ5SP85 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc85aQ5SP85 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms