Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trdv2-2Q5R1A4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 860 ms