Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim58Q5NCC9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim58Q5NCC9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim58Q5NCC9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim58Q5NCC9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim58Q5NCC9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim58Q5NCC9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms