Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb3Q571F5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms