Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C2cd3Q52KB6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C2cd3Q52KB6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2cd3Q52KB6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms