Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fam228bQ497Q6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam228bQ497Q6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam228bQ497Q6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms