Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4930567H17RikQ3V0K5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930567H17RikQ3V0K5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930567H17RikQ3V0K5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms