Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bbof1Q3V079 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Bbof1Q3V079 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms