Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C87499Q3UX49 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms