Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm10Q3UTQ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm10Q3UTQ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm10Q3UTQ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms