Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd9Q3UQU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms