Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lmod2Q3UHZ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lmod2Q3UHZ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lmod2Q3UHZ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lmod2Q3UHZ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lmod2Q3UHZ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lmod2Q3UHZ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmod2Q3UHZ5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms