Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrx1Q3TL44 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrx1Q3TL44 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrx1Q3TL44 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrx1Q3TL44 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.9 ms