Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc13Q3TIR1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms