Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2f1Q3THK3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2f1Q3THK3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms